截至2013年底，牛津共有39个学院，它们和学校的关系就像美国中央政府与地方政府的关系那样采用联邦制形式。每一所学院都由Head of House和几个Fellows管理，他们都是各种学术领域的专家，其中大多数在学校都有职位。6个准学院（称为“永久性私人学堂”Permanent Private Halls、为各宗教教派所办），至今还保留着它们的宗教特许状。
奖学制度
罗德奖学金
有“全球本科生诺贝尔奖”之称的罗德奖学金，每年在全球选取80名最优秀大四本科生去牛津大学攻读硕士或博士。
中国牛津奖学金
中国牛津奖学金(China Oxford Scholarship Fund, COSF)于1992年成立，提供已经取得牛津大学研究生入学许可的中国留学生申请，奖学金得主必须在学业完成后返回中国就业。奖学金申请人必须是中国内陆、中国香港或中国澳门的公民，而且是研究生，研究专业不限，奖学金金额从1,000英镑至12,500英镑不等。
中国教育部及牛津大学奖学金
中国教育部及牛津大学奖学金(Chinese Ministry of Education-University of Oxford Scholarships)是中国留学委员会和牛津大学合作出资的博士奖学金。这个奖学金每年有五个名额，是一个全额奖学金，包括学费和生活费。
克拉伦登奖学金
克拉伦登奖学金(Clarendon Fund scholarships)成立已届满10年，是牛津大学规模最大的国际学生奖学金，赞助非欧盟的留学生在牛津大学攻读本科以上的研究学位。但是从2011年9月起，克拉伦登奖学金的赞助对象不再限制于缴纳海外学费的学生，任何国籍的研究生都能申请。这个奖学金每年提供100多个名额，支付学费和生活费，2010至2011学年度牛津大学一共有297名来自46个国家的克拉伦登奖学金得主在进行各种研究。
太盟牛津奖学金
太盟牛津奖学金(Pacific Alliance Oxford Scholarships)是太盟投资集团(Pacific Alliance Group)支持的奖学金，专门资助学业优秀的中国留学生到牛津大学从事社会科学、数学、物理或生命科学等学科的博士研究。这个奖学金为期三年，支付学费和生活费，每年有两个名额，申请人必须是中国大陆居民（不包括港澳生）。
牛津大学裘槎奖学金
牛津大学裘槎奖学金(University of Oxford Croucher Scholarships)是牛津大学和香港裘槎基金会联合提供的奖学金，赞助优秀的学生在牛津大学从事自然科学、科技和医学相关的博士研究。这个奖学金为期三年，支付全额学费和生活费，每年有两个名额，申请人必须是香港永久居民。
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